Noviembre-diciembre de 1974. MGS Peace Walker: Incidente Peace Walker

Noviembre-diciembre de 1974. MGS Peace Walker: Incidente Peace Walker

Kazuhira Miller, que se cruzó a Big Boss como enemigo en el campo de batalla y terminó siendo el gestor económico de los MSF, trae a dos personas con una oferta para la organización. Ramón Gálvez Mena y Paz Ortega Andrade son respectivamente profesor universitario y estudiante de la "Universidad de la Paz" que requieren los servicios de Big Boss para que expulse a lo que parecen ser agentes de la CIA en territorio de Costa Rica, un país sin ejército propio. Big Boss adivina de inmediato que hay gato encerrado; el tal Ramón es en realidad Vladimir Zadornov, un agente de la KGB. Pero su oferta es demasiado tentadora: les regala una base petrolífera en medio del Caribe para que instalen una base definitiva a la que llaman Mother Base. Además, Zadornov tiene una cinta donde se escucha una voz sospechosamente parecida a la de The Boss, lo que termina de convencerle.

En Costa Rica se encuentra con la guerrilla local sandinista, con los hermanos Amanda y Ricardo "Chico" Valenciano Libre como cabezas visibles. El pequeño Chico jura que han visto un basilisco en la selva; siguiendo su rastro Big Boss se encontrará con el científico Huey Emmerich, que está desarrollando un proyecto armamentístico para lanzar misiles nucleares desde un tanque bipedal en base a los planos que le pasó un colega soviético: Metal Gear.

Huey acaba de ser despedido (y lanzado escaleras abajo en su silla de ruedas) por el agente de la CIA Hot Coldman, que está convencido de que la teoría de disuasión nuclear tiene un problema: en el evento de que un país ataque a otro con armas nucleares, es posible que una persona fuese incapaz de lanzar una respuesta sabiendo que estaría condenando a la especie a la extinción. Por ello fuerza a Huey a desarrollar un tanque móvil que se asegure una respuesta automática, que ejerza un poder de disuasión auténtico.

La IA corre a cargo de la Doctora Strangelove, que estuvo involucrada en el viaje espacial de The Boss y que lleva desde entonces obsesionada con ella. Su intención es dotar a la IA de la personalidad de la legendaria soldado, pero necesita información sobre sus motivaciones, y no duda en torturar a Snake para obtenerla y finalizar su trabajo.

Los datos definitivos se cargan en Peace Walker, el primer Metal Gear. Hot Coldman decide probarlo enviando datos falsos para que ataque Mother Base. Zadornov aparece para herirle de gravedad y emplear PW para lanzar un misil a Cuba, causando así un sentimiento anti-estadounidense en América Central, y favoreciendo la expansión de los soviéticos. Los sandinistas le detienen, pero Coldman tiene un as en la manga para poner a prueba la teoría de disuasión nuclear antes de morir: emplea la IA de Peace Walker para mandar datos falsos a la CIA, que tiene que decidir si contestar a la URSS con un ataque nuclear definitivo. La respuesta parece que va a ser positiva.

Big Boss se ve forzado a eliminar a Peace Walker, que en un momento de cordura se reconoce a si misma como The Boss y decide suicidarse para evitar el apocalipsis. Con la tecnología obtenida de PW y recogiendo su misil nuclear, Huey Emmerich es capaz de construir un tanque bípedo para Mother Base: Metal Gear ZEKE. Coldman fallece y Zadornov es apresado por Big Boss.

Tras varias huidas de Zadornov, queda claro que hay alguien dentro de la base que le está ayudando, y que termina por secuestrar ZEKE. Esa persona resulta ser Paz (o mejor dicho, Pacifica Ocean), que en realidad es una agente de Major Zero y pretende coaccionar a Big Boss: o vuelve con Zero o lanzará la cabeza nuclear a Estados Unidos para que todas las naciones del mundo les consideren enemigos. Tras vencerla, Paz cae el océano y se le pierde la pista. Una grabación en el final secreto nos revela que ella no era la única agente de Cipher a bordo...

En un discurso final, Big Boss informa a sus soldados de que han llamado la atención del mundo y estarán en los radares de otras fuerzas, pero que ellos seguirán peleando por aquellos países que no puedan defenderse. Pronto dejarán de ser soldados sin nación: formarán parte de la nación Outer Heaven.